1、抵达日本机场/港口
货物从中国起运抵达日本机场或港口，如果使用的是空运专线、空加派、快递直发等运输方式，那么货物抵达的便是日本的机场，在机场进行清关。如果货物是通过海运、海派等运输方式抵达日本，那么便抵达港口后再港口清关。
2、向日本海关提交运入申请书
抵达日本机场/港口之后，需要向日本海关提交运入申请书。海关收到运输申请书之后，会对货物进行查验、检查、审核，也就是我们所说的清关。
3、提供清关资料
提交清关资料给日本海关，包括原产地证、商检证明、货物申报以及其他特殊物品认证等文件，接受日本海关的查验。查验没有问题后，支付关税即可通关放行。查验有问题，例如申报价值不符、产品属于禁运品、产品无对应的认证文件等，那么货物便会被扣货。
4、进行关税缴纳
清关没有问题之后，我们需要根据物品对应的税率支付关税，通常代理会帮助我们完成缴税。日本关税起征点为10000日元，起征点比较低，发FBA到日本基本都要支付关税的。FBA头程物流有DDP预付关税模式，也有双清包税模式。预付关税是提前支付关税给货代，双清包税是只需支付运费，货物的清关缴税全部由代理解决。
由于双清包税需承担货物的关税缴纳，因此双清包税渠道都会比DDP预付关税渠道价格更高。大家可以根据自己的物流需求进行选择。
5、获取进口许可证
关税缴纳之后，便获得的进口许可证书，通过该证书我们便可以通关进行末端派送。空运末端一般是快递或卡车负责末端派送，快递无需预约，卡车需要提前预约亚马逊仓库。海运末端也分快递或卡车派送，快递派送快、无需预测，卡车派送难、成本低、需提前预约。